Benchling Automation permet aux équipes de concevoir une logique d’automatisation une fois, puis de la réutiliser et de la faire évoluer à chaque expérience. Une approche destinée à accélérer le passage de prototypes automatisés à des processus utilisables à grande échelle. Automatiser une expérience de laboratoire ne constitue qu’une première étape. La difficulté apparaît souvent lorsqu’il faut modifier le protocole, remplacer un instrument ou adapter l’analyse à un nouveau besoin scientifique.
Benchling lance Automation pour rendre ces workflows plus facilement réutilisables. La plateforme relie les équipements, les systèmes d’automatisation et les dossiers scientifiques afin que les équipes puissent modifier leurs processus sans devoir réécrire du code spécifique à chaque évolution. Les workflows déclenchés à la fin d’une analyse peuvent être créés et adaptés sans développement dédié. Leur logique est définie une fois puis réutilisée lors des exécutions suivantes.
Passer du prototype à une automatisation reproductible
La solution peut orchestrer l’exécution d’une expérience sur un instrument ou une cellule automatisée, récupérer les données puis déclencher automatiquement les analyses nécessaires. Benchling s’appuie pour cela sur un écosystème comprenant notamment HighRes, Automata, Ginkgo Bioworks, Celltrio, Opentrons et Hamilton. Les intégrations standardisées doivent permettre de faire évoluer les équipements sans remettre en cause l’ensemble du workflow. Les équipes disposent également d’un accès à plus de 200 instruments via fichiers ou API.
Associer automatisation standardisée et analyses personnalisées
Benchling conserve parallèlement une possibilité de personnalisation pour les équipes ayant des besoins plus spécifiques. Les scientifiques peuvent intégrer directement du code Python à leurs workflows afin d’exécuter leurs propres transformations et analyses sans recourir à un outil externe. Cette combinaison entre automatisation standardisée et code personnalisé doit permettre aux laboratoires d’éviter deux extrêmes : des processus entièrement manuels d’un côté, ou des architectures automatisées difficiles à modifier de l’autre.
Avec Benchling Automation, l’objectif est donc moins d’automatiser une expérience isolée que de construire des processus scientifiques capables d’évoluer avec les protocoles, les équipements et les besoins de R&D.
